幼时曾深陷绝望深渊的直枝理树，与4位少年少女相遇了。　　在那之后数年，理树作为Little Busters的一员，喧闹地过着快乐的每一天。　　这样的时间能够一直持续就好了。理树所期望的只有这样。　　某日，恭介突然表示要成立一支棒球队伍，　　理树则开始了寻找成员的任务。　　在这样的过程中，理树邂逅了新的成员们。　　和大家一起参加试胆大会，潜入女生宿舍时被换上女装，一起演人偶剧……。　　经历了许多快乐的事情，　　同时也在大家的帮助下解决了各自拥有的烦恼。　　最后在棒球比赛中，理树确认了和最好的朋友们之间的牵绊。　　——然而，这并不是结束。　　和来谷唯湖之间的故事。　　理树与铃的故事。　　以及，理树和铃终于知晓的“世界的秘密”。　　Little Busters真正的物语，自此开始——。

　　八坂一（三瓶由布子 配音）是一位热爱科学的平凡少年，他坚信世界上的一切都可以用科学解释。然而，某一日，八坂一邂逅了名为岚山小夜子（白石凉子 配音）的神秘少女，她的出现以及随后而来的不思议事件颠覆了八坂一的全部世界观。　　两人的相遇令他们获得了穿越回过去的特殊能力，与此同时，女扮男装的上贺茂润（小见川千明 配音）、同样拥有穿越时空的能力的德国少女可雅（名冢佳织 配音）、一直追随着小夜子的墨镜男村田英雄（安元洋贵 配音）、痴情而又倔强的山崎加奈子（堀江由衣 配音）以及身世神秘的少女伏见弥生（野中蓝 配音），这些角色接二连三的出现在八坂一的身边。

　　国立爱丽丝研究机关学园本部不同于一般的学园，只招收具备特殊能力的学生，这种能力被称之为“爱丽丝”。因为好友今井萤（钉宫理惠 配音）转学从乡间来到了城里的爱丽丝学园，无论如何也不想和萤分开的佐仓蜜柑（植村加奈 配音）因此离家出走，跟随萤来到了学园。但没有超能力的她根本无法进入，被学院老师鸣海先生（石田彰 配音）救助后，意外地开发了蜜柑的超能力，于是，机缘巧合下，蜜柑也进入了爱丽丝学园，达成了她和萤在一起的愿望。　　新学校的生活有喜有忧。蜜柑所具备的超能力被同学嗤笑为最无用能力，和其搭档的又是问题少年日向枣（朴璐美 配音），不能见相依为命的爷爷，在各种挫折困难面前，蜜柑依然乐观应对，逐渐赢得了大家的喜欢，也收获了和枣的爱情，但前路依旧有各种困难在等着他们……

　　The story tells that taoyue college, which aims at free school spirit, has a special teacher, Rebecca Miyamoto! Although moxia.cc she has a brilliant mind, her character is still as unpredictable as a child.

　　作为实现愿望的代价，在无人知晓的情况下不断战斗的魔法少女们。然而，环伊吕波，却忘记了自己的愿望。“成为魔法少女的时候，我是许了什么愿望来着？”日常当中突然出现的空洞。失去了的某件重要之物。连理由都不知道，就这样kkju.cc每天不停地战斗…… 就在此时，魔法少女之间开始流传某个传闻。“若能去神滨的话，魔法少女就能得到拯救”。魔法少女与传闻集中的城市，神滨市。寻求着自己失去的愿望，环伊吕波的故事开始了——

　　新生私立女子校·五棱馆学园背后有着不为人知的一面——由于时空歪曲而出现的谜之妖魔“Oburi”。能与这些人类之敌对抗的，唯有具备能探知五次元空间能力的被作“Striker”的少女们。五棱馆学园同时也是选拔出具备素养的少女们，并养成讨伐Oburi的战斗部队“Fifth Force”的机关。隶属于新结成的队伍“Altair Torte”的五位少女的战斗与友情的物语开幕！

　　

　　故事发生在遥远的未来，彼时的世界被邪恶的马尔戈力达帝国统治，作为领导者，马尔戈力达四世（松野太纪 配音）组织了一支令人闻风丧胆的拔毛部队，为了掩饰自己寸草不生的头顶，他意在将所有的子民们都变成光头。就在这危机时刻，一个名叫波波波（子安武人 配音）的男人站在了马尔戈力达四世的对立面。这个奇怪的男人留着显眼的金黄爆炸头，自称能够听懂毛的语言，并且巧妙的将毛变为了他的武器。　　就这样，波波波和马尔戈力达四世的漫长战争开始了。在同伴小美（野中蓝 配音）、东八奇（小野坂昌也 配音）和阳顶天之助（园部启一 配音）等人的帮助下，他能够获得最终的胜利吗？

　　遥远的未来——　　人类分裂成了以有人兵器Strain为主战力（联合）和以无人兵器Tomorrow为主战力（帝国）的两大阵营，从而开始了永无止息的战斗。　　现年16岁的セーラ·ウィーレック是联合阵营的名门独生女，就读于クラニアル星域的寄宿制リーズナー养成机关クラベラ空间机甲兵科学院，并且一心想成为リーズナー（Strain驾驶员）。成绩优秀的她的心中有个秘密，就是期望与最爱的哥哥再相会……　　セーラ的哥哥ラルフ·ウィーレック在赛拉11岁的时候接到了特殊命令到远在130光年之外的最前线出击。虽然途中乘坐的是联合最为先进的亚光速战舰，客观时间也要经过400年。但主观时间（搭乘员的感觉到的时间）由于受到“ウラシマ效应”的影响实际上只是经过了2年。因此，セーラ想要见到哥哥，就必须也前去同样的战场。　　兄妹两自小就失去了双亲，因此セーラ对哥哥有着超越普通亲人的感情，兄妹再会被她视为自己活着的意义。　　セーラ能够与哥哥再相见吗？

　　备长炭（野中蓝 配音）是一个身材娇小的蓝发少女，身着传统和服的她独自一人居住在林中的老屋之中。虽然独自生活有时会觉得孤独，但个性单纯开朗又勤劳的备长炭还是决定好好的珍惜每一天的时光。　　好在孤独的日子不算太久，很快，备长炭的身边就聚集了一群同样可爱的朋友们，她还让出生在深宅大院的栎炭（野川樱 配音）明白了自己的命运应该由自己来掌控的道理。除此之外，胆小但聪明的竹炭（门胁舞 配音），其妹竹林（福圆美里 配音），天然呆桉树炭（中原麻衣 配音），无论哪方面看来都十分普通的芦荟（斋藤桃子 配音）还有傲娇可爱的莲炭（佐藤利奈 配音），她们都将备长炭看做自己不可缺少的朋友。在深林小屋中，备长炭快乐一天又开始了。