サイクルロードレースに青春を燃やす高校生たちの成長や友情を描いた人気アニメ「弱虫ペダル」の完全新作劇場版。原作者の渡辺航が原案を担当した、オリジナルストーリーが描かれる。全国大会（インターハイ）で激闘の末に総合優勝を勝ち取った総北高校自転車競技部の小野田坂道は、卒業を控える3年生の指導の下、「全員で支え合い走りぬく」というチーム総北の魂を継承するため、日々の練習に励んでいた。そんなある日、チーム総北に、インターハイの成績優秀チームが出場する「熊本　火の国やまなみレース」からの出場招待が届く。打倒総北に燃えるライバルチームや地元・熊本台一など、全国の強豪が集まるレースに向け、坂道たちは士気を高めていくのだが……。

这个世上，除了人类的世界以外，还有另外一个世界ーー那就是怪物的世界。人类世界的「涩谷」与怪物世界的「涉天街」，两个世界本应没有交集。不过有一日，有一个人类少年「莲」迷失在怪物的世界，成为了怪物「熊彻」的弟子，并被授予了九太这个名字。这一偶然的相遇，正是超乎想象的冒险的开始。