中途岛战役失利直接宣布了日军在太平洋战场上的失败，负隅顽抗的日军依然坚守日本最南端的小岛—硫磺岛。这个看似不起眼的小岛，却上演了二战太平洋上最惨烈的战争。　　栗林忠道中将（渡边谦 饰）是日军在硫磺岛的指挥官，负责这道日军最后的防线。栗林中将大力改革日军内部的陋习和不足，并设计出一整套对付美军、以拖延为主的作战方案。虽然他和日军的二万名官兵都上下齐心，但面对占尽空中优势的四万名美军士兵，栗林知道这将是一场没有归路的战争。　　在最后的战争之前，栗林写下了他最后的家书……

孤儿仙波留吉（加濑亮 饰）怀揣对电影的热爱来到京都，拜入猎户电影院老板丰田松藏（宇崎龙童 饰）门下学习电影放映。不久丰田因病去世，留吉和丰田之妻登世（宫泽理惠 饰）继续支撑着电影院的运营。两人相互扶持，不离不弃，渡过了电影业的衰退期，亦承受着他人冷嘲热讽和流言蜚语。

在日本美术史上，熊谷守一被认为是野兽主义画家，他出身富裕却过着贫寒生活，获誉“画坛仙人”。影片讲述了熊谷守一30年几乎不出门，在家创作“仙人物语”的故事。

沈丁花花芽是一个从不相信任何玄幻理论的职场女子，不过她深信童年时曾遭到玩具招财猫的诅咒，以至于人生总是充满坎坷。花芽原本是蒲公英出版社下一本女性时尚杂志的编辑，然而杂志销量一路走低，最终不得不关张大吉。丢掉工作的她无法完成去意大利找男朋友的梦想，又遗失了心爱的宠物小兔子。更大的打击接踵而来，她的妈妈花翠跌入沼泽后陷入昏迷。花芽从母亲的信件中得知生身父亲的下落，出于好奇，她启程前去寻找。结果发现，父亲竟然是一个穿着邋遢、举止怪异、绰号“灯泡”的糟老头。这对父女将会有怎样的故事发生呢？

掌控日本国家未来的御前会议上，众要员商议着以猎杀SPEC持有者为目标的“SIMPLE PLAN”，神秘的法蒂玛第三预言亦被提及。数天后，暗中执行猎杀计划的政府成员突然于游艇上全员木乃伊化死亡。案件交由未详系的当麻纱绫（户田惠梨香 饰）和濑文焚流（加濑亮 饰）负责。调查途中两人接到志村美玲（福田沙纪 饰）的求救电话，赶赴救援时与濑文的前同僚兼前恋人青池里子（栗山千明 饰）不期而遇。当麻将美玲带回未详系，原本已经死去的阳太/一十一（神木隆之介 饰）竟从容现身于她们面前。竭力压制着蠢蠢欲动的左手，当麻无力的目睹美玲匆忙留下“一定要阻止法蒂玛第三预言”的信息后被阳太带走。 　　在阳太的恶意煽动下，普通人类与SPEC持有者间的矛盾日益激化。身处两者夹缝之中，当麻对法蒂玛第三预言和人类未来的走向充满了迷惑。玛利亚、白衣教皇、左手持火之剑的天使……预言中的关键人物们若隐若现，黑暗降临的未来是否终将无法避免？

经过与一十一（神木隆之介 饰）的恶战，濑文焚流（加濑亮 饰）身受重伤，命几不保。在此期间，青池里子（栗山千明 饰）随女儿小润（森山树 饰）悄然离开医院；而各国政要的一次关于简单计划的秘密会议上，自称卑弥呼的日本代表抹杀所有人，他代表SPEC持有者正式向普通人类宣战。世态险恶的当下，濑文急急出院，和当麻纱绫（户田惠梨香 饰）一同调查青池母女的行踪。而野野村组长（龙雷太 饰）则独自行动，查找简单计划病毒疫苗的下落。新的SPEC持有者交替登场，残酷的杀戮却从未停止。关于前人类的秘密昭然若揭，惨烈浩大的人种战争即将拉开序幕……本片为SPEC系列完结篇的前篇。

前人类和普通人类的人种战争已经到了白热化的阶段，野野村组长去世后，吉川（北村一辉 饰）、当麻纱绫（户田惠梨香 饰）和濑文焚流（加濑亮 饰）等人聚在未详总部，苦苦思索J教授的真身。谁知就在当麻刚刚弄清真相的同时，警察医院内的成年和儿童SPEC持有者遭到残忍屠戮。愤怒的当麻无法抑制体内被封印的SPEC，她狂乱暴走，继而现身御前会议。在犹大、世界（向井理 饰）、润（大岛优子 饰）的见证下，法蒂玛第三预言实现了。恐怖刺眼的蘑菇云在上空升起，成千上万的八尺乌遮天蔽日，被欲望所支配与荼毒的世界迎来了毁灭时刻。 　　在命运的交叉点，当麻和焚流能否阻止世界的灭亡？

伊诺是一个有点奇怪的年轻人，他似乎对生活毫无兴趣，却喜欢在陌生人的葬礼上游荡。在一次葬礼期间，他偶然邂逅了一位独特的女孩安娜贝尔，两人渐渐成为无话不说的好朋友。伊诺向安娜贝尔介绍自己的一个鬼魂朋友浩，安娜贝尔则与伊诺分享她为之痴迷的达尔文学说。然而好景不长，就在两人关系日渐亲密，生活的乐趣也慢慢复苏之时，安娜贝尔告诉了伊诺一个事实——她是一个将不久于世的癌症病人。面对着一边是难以割舍的韶华时光，一边是无法改写的死之永夜，这段不寻常的爱情将以怎样的方式对抗生命的流逝……